MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013205	CGA	2	6	2815649	2815654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_013205	GGCG	2	8	2815680	2815687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_013205	AGT	2	6	2816394	2816399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_013205	GC	4	8	2817503	2817510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7005	NC_013205	GGCGA	2	10	2817563	2817572	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7006	NC_013205	CCT	2	6	2817626	2817631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_013205	TTG	2	6	2817679	2817684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_013205	GCG	3	9	2819052	2819060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_013205	GC	3	6	2820017	2820022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_013205	GCC	2	6	2820368	2820373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_013205	CAT	2	6	2820413	2820418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_013205	CTCAC	2	10	2820880	2820889	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7013	NC_013205	CCT	2	6	2822313	2822318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7014	NC_013205	CAC	2	6	2823210	2823215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_013205	ACGGC	2	10	2823242	2823251	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7016	NC_013205	TCC	2	6	2826170	2826175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_013205	TTG	2	6	2826178	2826183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_013205	TTCG	2	8	2826196	2826203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7019	NC_013205	CTT	2	6	2827002	2827007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_013205	AG	3	6	2827682	2827687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_013205	TG	3	6	2827697	2827702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_013205	CCA	2	6	2827736	2827741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_013205	AAGG	2	8	2827785	2827792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_013205	GC	3	6	2827808	2827813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_013205	GCC	2	6	2829937	2829942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7026	NC_013205	GGC	2	6	2829949	2829954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_013205	CGC	2	6	2831272	2831277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7028	NC_013205	TCC	2	6	2832496	2832501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_013205	AGG	2	6	2832544	2832549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_013205	CCT	2	6	2833158	2833163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_013205	CG	3	6	2833196	2833201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_013205	ATG	2	6	2833202	2833207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_013205	TCC	2	6	2834861	2834866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7034	NC_013205	ATGC	2	8	2834883	2834890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7035	NC_013205	CTTC	2	8	2834906	2834913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7036	NC_013205	CA	3	6	2834933	2834938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7037	NC_013205	TC	3	6	2834941	2834946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7038	NC_013205	TGT	2	6	2834973	2834978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_013205	TGGA	2	8	2834985	2834992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_013205	CGG	2	6	2835036	2835041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_013205	CCT	2	6	2835619	2835624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_013205	CGG	2	6	2835626	2835631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_013205	CG	3	6	2835768	2835773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_013205	TCCG	2	8	2835776	2835783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_013205	TCC	2	6	2835816	2835821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_013205	CGG	2	6	2835827	2835832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_013205	GCC	2	6	2835834	2835839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7048	NC_013205	CAA	2	6	2835842	2835847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_013205	GC	3	6	2835868	2835873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_013205	CGC	2	6	2835900	2835905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_013205	GAA	2	6	2835954	2835959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_013205	CCG	2	6	2836287	2836292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_013205	AGA	2	6	2836307	2836312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_013205	CTC	2	6	2837472	2837477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7055	NC_013205	CCT	2	6	2838189	2838194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_013205	CAGT	2	8	2838205	2838212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7057	NC_013205	GCG	2	6	2838244	2838249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_013205	CCTC	2	8	2840279	2840286	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7059	NC_013205	AC	3	6	2840654	2840659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7060	NC_013205	GAT	2	6	2840664	2840669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_013205	CTT	2	6	2840740	2840745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_013205	GC	3	6	2840815	2840820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7063	NC_013205	GA	3	6	2840872	2840877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_013205	GAT	2	6	2840879	2840884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_013205	CCG	2	6	2840930	2840935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_013205	TCTT	2	8	2841062	2841069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_013205	GCG	2	6	2841166	2841171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_013205	C	8	8	2841175	2841182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7069	NC_013205	TTTTTC	2	12	2841207	2841218	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7070	NC_013205	GC	3	6	2841223	2841228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7071	NC_013205	CGG	2	6	2842558	2842563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_013205	CGC	2	6	2842568	2842573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_013205	CGT	2	6	2842627	2842632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_013205	CAC	2	6	2842648	2842653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_013205	GAG	2	6	2842738	2842743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_013205	GC	3	6	2842751	2842756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7077	NC_013205	GAG	2	6	2842757	2842762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_013205	GTT	2	6	2842796	2842801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_013205	GTA	2	6	2842812	2842817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_013205	TC	4	8	2843616	2843623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_013205	CG	3	6	2843645	2843650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_013205	ACC	2	6	2843663	2843668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7083	NC_013205	GC	3	6	2843689	2843694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7084	NC_013205	TCGGC	2	10	2843706	2843715	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7085	NC_013205	TCC	2	6	2845815	2845820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7086	NC_013205	CA	3	6	2845842	2845847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_013205	CTTCC	2	10	2846440	2846449	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7088	NC_013205	CCGA	2	8	2846618	2846625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7089	NC_013205	TCG	2	6	2846645	2846650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_013205	TGA	2	6	2846654	2846659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_013205	ACCG	2	8	2846673	2846680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7092	NC_013205	CG	3	6	2847498	2847503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7093	NC_013205	GAT	2	6	2850027	2850032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_013205	AGG	2	6	2850075	2850080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_013205	TAT	2	6	2853098	2853103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_013205	GGA	2	6	2853152	2853157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_013205	CG	3	6	2853179	2853184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7098	NC_013205	TC	3	6	2853230	2853235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7099	NC_013205	CAT	2	6	2853270	2853275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_013205	CAT	2	6	2853319	2853324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_013205	ACC	2	6	2853366	2853371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7102	NC_013205	CTT	2	6	2853391	2853396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_013205	C	6	6	2853399	2853404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7104	NC_013205	ACGA	2	8	2853410	2853417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7105	NC_013205	TCC	2	6	2856256	2856261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7106	NC_013205	AAAC	2	8	2856292	2856299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7107	NC_013205	TC	3	6	2856310	2856315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_013205	CA	3	6	2856399	2856404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_013205	CG	4	8	2858517	2858524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7110	NC_013205	GCTC	2	8	2858531	2858538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_013205	GCG	2	6	2859859	2859864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_013205	CTC	2	6	2860116	2860121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_013205	CAA	2	6	2860129	2860134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_013205	GCC	2	6	2860152	2860157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_013205	GCC	2	6	2861010	2861015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7116	NC_013205	CGG	2	6	2861028	2861033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_013205	CTT	2	6	2861034	2861039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_013205	ATC	2	6	2861071	2861076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_013205	CGC	2	6	2861447	2861452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7120	NC_013205	CGG	2	6	2861455	2861460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_013205	CTC	3	9	2861931	2861939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_013205	CTC	2	6	2861961	2861966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7123	NC_013205	GAA	2	6	2861981	2861986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_013205	CGC	2	6	2862003	2862008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_013205	GGC	2	6	2862022	2862027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_013205	CAT	2	6	2862268	2862273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_013205	CGAAA	2	10	2862288	2862297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7128	NC_013205	CG	3	6	2863367	2863372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7129	NC_013205	CAT	2	6	2863384	2863389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_013205	GAG	2	6	2863436	2863441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_013205	CCG	2	6	2863868	2863873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7132	NC_013205	GAG	2	6	2863898	2863903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_013205	CCG	2	6	2865179	2865184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7134	NC_013205	GAG	2	6	2865193	2865198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7257	NC_013205	TA	3	6	2921135	2921140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7263	NC_013205	ACT	2	6	2922296	2922301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7398	NC_013205	GC	3	6	2985653	2985658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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